事实上，康熙皇帝的禁海政策，对暂时防止“海寇”泛滥，以及“海寇”与西方殖民势力勾结，巩固清朝统治的确有一定的意义。但从长远的意义上考察，它是落后的、保守的政策，因为它不利于沿海地区经济的发展。虽然它并未中断对外贸易，但却使中外贸易受到很大的限制。中国商人和渔民已不能自由外出；外国商人虽然能自由来华，但也不能与中国商民自由接触，而是在严密监视下，由洋行等中间机构代办。并且，出口的商品也有严格限制，除禁止硝磺、军器、火药、钢铁、粮食、马匹、书籍出口之外，后来生丝也被列入禁项。因此，禁海对我国东南地区商品经济的发展及沿海人民的生活都产生一定的影响。闽人以海为生，禁海后，虽偷越禁洋者不一而足，然而究竟不能任意往返，结果是“土货滞积，而滨海之民半失作业”。有人将禁海前后东南沿海人民生活作了对比，写道：“南洋未禁之先，闽广家给人足，游手无赖亦为欲富所驱，尽入番岛，鲜有在家饥寒窃劫为非之患；既禁以后，百货不通，民生日蹙”“一船之敝，废中人数百家之产”“使沿海居民，富者贫，贫者困，驱工商为游手，驱游手为盗贼”。康熙六十年(1721),台湾爆发了朱一贯领导的农民起义，与这次禁海有直接关系。因闽广之民偷越禁洋，不能任意往返，集聚台湾者日多，“或为饥寒所迫，或为不肖官员刻剥”,便被迫杀死官兵，爆发了起义。康熙皇帝清楚地看到了这次起义由内地之民在台湾举事，但他没认识到是因为自己禁海所引起的错。