事实上，李立三并没有在意他与林彪之间的矛盾，他怀着15 年未参加国内革命斗争的遗憾和满腔热情，忘我地工作。1946 年4月，李立三化名李敏然，开始参加三人小组的工作。三人小组即军事调处执行部，负责和国民党进行停战谈判。
6 月，李立三成为东北地区三人小组的负责人，根据党的政策，与国民党针锋相对，为争取我军在东北地区休整时机作出了贡献。秋天，李立三又担任东北军区对外联络部部长和东北局敌工部部长，在负责与美国联系中，完成了数万名日侨的遣送工作；负责同苏联的联系时，经党中央批准，将廖焕星、贺子珍、林莉等人从苏联调回并安排了工作。
1947 年5月，李立三又奉命出任东北局城市工作部长，此后负责中共中央东北局翻译组工作，翻译出版了俄文版《毛泽东选集》、《中国土地法大纲》等，后又参加筹备恢复中华全国总工会的工作。
在李立三的努力下，1948 年8 月，第六次全国劳动大会在哈尔滨召开，李立三被选举为中华全国总工会常务副主席、党组书记，会后兼任东北总工会主席，终于再一次登上全国总工会的领导岗位。
不久后，即1949 年初，北平和平解放。2月，七届二中全会在河北省平山县西柏坡召开，李立三前往出席会议。这是李立三近20 年来首次出席中央全会，激动的心情可想而知。在会上，他作了长篇发言，诚恳而又深刻地检讨了曾经所犯的错误，受到与会者好评，刘少奇在大会总结中对他提出表扬。会后，李立三来到北平，出任中共中央职工运动委员会书记、中华全国总工会党组书记，根据毛泽东指示，主要从事全国总工会工作。