严世蕃、罗文龙被朝廷发配雷州、寻州,严世蕃走到一半就逃跑了,回江西老家。罗文龙刚刚到寻州没多久,也偷偷溜掉,去了徽州,经常去江西与严世蕃来往。他们强迫老百姓四千人给他们修建豪宅,还收容了许多江洋大盗。御史林润视察长江防务,了解到严世蕃等人的实际情况,就上疏给朝廷:“臣巡视上江,备访江洋群盗,悉窜入逃军罗龙文、严世蕃家。龙文卜筑深山,乘轩衣蟒,有负险不臣之心。而世蕃日夜与龙文诽谤时政,摇惑人心。近假名治第,招集勇士至四千余人。道路恟惧,咸谓变且不测。乞早正刑章,以绝祸本。”告发两人蛊惑人心,意图造反。嘉靖皇帝闻讯大怒,让你们去戍边,你们不去,还跑到乡里为非作歹。赶紧抓起来,给他们定罪。逮捕令是从北京发出的,严氏父子在锦衣卫还有人,就通风报信,请严世蕃赶紧去雷州,不要在家待着。谁知信还没送到,林润已经到了,严世蕃猝不及防,被抓了个现行。
刑部尚书黄光升与大理寺官员以及御史们商议,怎么把严世蕃置于死地,思来想去,决定弹劾他们陷害杨继盛、沈炼等人的事情。消息传到严世蕃耳朵里,他反而特别高兴:这下没有性命之虞了。黄光升把奏折交给徐阶,请徐大人指点指点,徐阶说:“你们是想让严世蕃活下来吗?”大家疑惑不解,怎么可能!我们是要让他死!徐阶又说:“沈炼、杨继盛等案件,虽然是严嵩下的手,但拍板的是当今圣上,你们用这些罪名弹劾严世蕃,从侧面说明皇帝的决策是不对的。这份奏章要是真的交上去了,严世蕃可以出狱,你们都要倒大霉!”那怎么办?把涉及皇帝的内容全部删掉,以阴谋造反、勾结倭寇的罪名起诉。刑部尚书恍然大悟,原来如此呀!高!实在是高!严世蕃听说黄光升修改了罪名,感觉大事不妙,绝望地说:“这下完了!”果然,嘉靖皇帝批准了三法司的审判结果,将严世蕃斩首并抄家,搜出黄金三万余两,白金二百万余两,还有价值数百万的珍宝、古玩、高档服装等等。